Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK2Q15119 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms