Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms