Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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