Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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