Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms