Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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TRIM25Q14258 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TRIM25Q14258 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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