Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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