Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms