Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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