Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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