Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TRAF1Q13077 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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