Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms