Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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