Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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