Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms