Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms