Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms