Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms