Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms