Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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