Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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