Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms