Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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VBP1P61758 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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VBP1P61758 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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VBP1P61758 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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VBP1P61758 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VBP1P61758 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VBP1P61758 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VBP1P61758 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VBP1P61758 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VBP1P61758 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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