Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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