Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP7P55210 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP7P55210 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP7P55210 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP7P55210 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP7P55210 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP7P55210 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms