Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms