Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms