Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTBP49356 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms