Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK8P49336 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK8P49336 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms