Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSKP41240 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSKP41240 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSKP41240 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSKP41240 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSKP41240 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSKP41240 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms