Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT20P35900 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRT20P35900 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRT20P35900 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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