Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DDIT3P35638 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms