Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms