Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms