Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms