Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PSMB9P28065 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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