Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms