Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRGP23470 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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