Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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TSPAN8P19075 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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TSPAN8P19075 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TSPAN8P19075 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TSPAN8P19075 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TSPAN8P19075 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TSPAN8P19075 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPAN8P19075 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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