Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGB6P18564 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGB6P18564 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGB6P18564 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGB6P18564 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGB6P18564 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGB6P18564 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGB6P18564 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms