Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms