Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI2P10070 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI2P10070 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI2P10070 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms