Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC175P0C221 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC175P0C221 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms