Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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