Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TULP3O75386 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TULP3O75386 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms