Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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