Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EDIL3O43854 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EDIL3O43854 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms