Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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