Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VILLO15195 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VILLO15195 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VILLO15195 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms