Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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